SYMPLEX – 北京大学推出的功能基因深度挖掘大模型

SYMPLEX是什么？

SYMPLEX 是由北京大学钱珑团队发布的功能基因深度挖掘大模型平台，专为生物制造和合成生物元件设计服务。平台结合大语言模型能力与结构化生物知识，能够从海量文献中自动提取与标注功能基因，并提供基因功能推荐、结构分析与知识图谱生成等功能，推动从序列到应用的基因资源发现。

SYMPLEX 的主要功能

• 文献智能提取（PubEngine）：支持千万级生物学文献的高通量语义解析与检索，自动提取基因与功能关联。
• 基因功能标注（GeneTagger）：通过自然语言处理与生物信息算法，从文献中提取细粒度分子机制与生物过程信息。
• 标准化知识对齐（GeneNorm）：将提取信息与专家知识库对齐，构建系统化“功能基因知识树”与关联模式。
• 跨物种基因挖掘：支持从不同物种基因组中挖掘稀有酶种与功能元件，如高性能 mRNA 加帽酶。
• AI 驱动的基因推荐：提供可直接用于疫苗、代谢通路、合成元件设计的候选基因集合与变体组合。

SYMPLEX 的适用场景或人群

• 合成生物学研究人员：快速获取可工程化的功能基因，辅助通路设计与酶优化。
• 生物制造企业与药企：用于发掘疫苗、蛋白药、底物转化等关键催化酶资源。
• AI for Science 研究者：研究 LLM 在结构知识提取、因果链生成、生物信息集成中的应用能力。
• 生命科学开发者：对接基因设计平台、图谱引擎、蛋白生成系统，实现从知识到应用闭环。

如何使用 SYMPLEX

SYMPLEX 提供在线交互式平台（https://bdainformatics.org/page?type=SYMPLEX），支持用户注册后免费使用。平台采用模块化设计，支持独立调用或集成分析，适用于科研实验、数据分析和酶资源发掘等实际场景。

论文发表期刊：Science Advances